是宮崎駿的長子、木版畫家宮崎敬介的哥哥。宮崎吾朗自信州大學農學部森林工學科畢業後,於株式會社森綠地設計事務所工作。他做為建設顧問,從事了公園綠地和都市綠化等的計劃和設計。之後,負責了三鷹之森吉卜力美術館的總合設計,並在運營公司的株式會社Muzeo・Dalte・Ghibli擔任代表理事。三鷹之森吉卜力美術館竣工後,擔任了其第一代館長並擔任了株式會社MAMMA AIUTO團第一代社長。財團法人德間紀念動畫文化財團的理事。
他還擔任了於2006年7月在日本上映的吉卜力工作室作品「地海戰記」的導演與其插曲「瑟魯之歌」和主題曲「時之歌」的作詞。這是他第一次參與動畫製作,並也是第一次執導一部電影。
他贏得了2004年度藝術選獎文部科學大臣新人賞,藝術振興部門。
宮崎吾朗與父親宮崎駿的關係並不融洽,他本人曾表示,父親是一位工作狂,「他是一百分的導演,卻是個零分的爸爸。」